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链球菌属肺炎球菌(Streptococcus pneumoniae)的完整基因组序列已经测定完毕并于近期发表.对肺炎球菌基因组序列进行了详细分析,研究了基因组密码子的使用模式和影响密码子使用的因素.高水平表达基因的密码子第三位碱基使用胞嘧啶(C)的频率比表达水平低的基因使用C有显著的提高,表达水平较低的基因在密码子的第三位碱基更趋向使用鸟嘌呤(G).基因的表达水平与对应分析的第一条向量轴呈显著相关(R=0.86).比较表达水平高、低的两组基因的密码子使用模式发现,基因的表达水平对于密码子使用有显著的影响.