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目的了解云南省2008-2012年艾滋病病毒Ⅰ型(HIV-1)耐药基因检测及临床应用情况。方法采用反转录套式聚合酶链反应(RT-nested-PCR)方法,检测病毒抑制失败病人血浆HIV-1耐药基因型。结果截止2012年12月31日,云南省累计治疗艾滋病(AIDS)病人38 055人。2008-2012年,HIV-1病毒载量(VL)检测率逐年提高(54.0%~95.2%)。HIV-1VL<50拷贝/mL者占88.7%,VL在51~1000拷贝/mL者占3.4%,VL>1 000拷贝/mL者占7.9%。对VL>1 000拷贝/mL病人血浆进行HIV-1耐药基因突变检测,共检测3 766人次,获得可用序列2 586例。其中未检出耐药突变的占46.2%(1 196/2 586),发生耐药突变的占53.8%(1 390/2586)。以2012年末累计治疗人数为基数,计算得到抗病毒治疗(HAART)人群的耐药发生率为3.7%(1 390/38055)。16个地市中除丽江和迪庆两地未发现耐药毒株外,其余各地均有不同程度的耐药发生。核苷类反转录酶抑制剂(NRTI)、非核苷类反转录酶抑制剂(NNRTI)和蛋白酶抑制剂(PI)的突变率分别为63.3%、95.1%和8.5%。NRTI突变位点的前3位依次为M184V/I(52.7%)、T215Y/F(11.7%)、D67N(10.2%,),NNRTI前3位是K103N/S(37.8%),G190A/S/E(24.4%),Y181C/I/V(22.0%),PI出现最多的是L33F,其次还有M46I、V82A。结论云南省抗病毒治疗病毒学失败病人中,以NNRTI耐药最为多见,其次为NRTI,PI较少,各地、市HIV耐药发生存在一定差异。HIV耐药基因检测有助于科学抉择治疗方案,在提高HAART的效果的同时,有效地节约匮乏的药物资源,减少耐药毒株的流行传播。