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医院的预算管理、财务运行制度是公立医院改革的内容之一，2009年4月《中共中央国务院关于深化医药卫生体制改革的意见》针对建立规范的公立医院运行机制提出：“进一步完善财务、会计管理制度，严格预算管理，加强财务监管和运行监督。”因此，大中型公立医院实行总会计师制度，对医院经济管理、会计核算等具有重要的意义。