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微型DNA条形码（微码）已成为未来DNA条形码技术发展的趋势，其在对典型的500bp左右的“全长”条形码进行分析的基础上筛选得到短于25bp的寡核苷酸“微型”条形码，该技术在与微阵列为基础的分析平台相结合的情况下，可实现同时对上百个未知物种进行快速检测和鉴定。后者由于使用了更短的DNA片段，因此从字面意义上讲更类似于商品条形码。目前已成功开发的2种真菌鉴定平台均采用以可重复使用的尼龙膜为基础的大型阵列和Luminex系统。阵列为基础的技术在对人呼吸道分泌物等组成复杂的微生物样本进行检测时优势比较明显，但考