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前景选择和背景选择是抗丝黑穗病分子标记辅助育种中的关键一步。本研究选用吉1037为供体亲本,京24为受体亲本,利用SSR分子标记,基于荧光毛细管电泳检测系统,最终筛选出两对前景引物（MZAI,661）和45对背景引物。对回交二代（BC2）群体鉴定结果表明,携带主效抗病QTL的植株比不带主效QTL的植株抗病率提高约22%。本研究结果为回交改良抗丝黑穗病分子育种提供了研究基础。