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海峡两岸药物临床试验的合作协议减少了重复性临床试验,将极大地促进海峡两岸新药的研发和上市。新药临床试验数据的保护直接取决于海峡两岸不同的法律规定。相较于中国台湾地区,中国大陆地区对于新药临床试验数据保护内容上的限制更能充分体现对于TRIPS协议弹性条款的应用,而在保护的时间和方式上,中国台湾地区更能考虑到新药上市所需的审批时间,值得中国大陆地区借鉴。