【摘 要】
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采用高通量测序技术分析了陕甘花楸(Sorbus koehneana)的叶绿体全基因组,并探讨其与爪瓣花楸(S.unguiculata)的关系.陕甘花楸叶绿体基因组全长159 873 bp,GC含量为36.60％,呈典型的四分体结构,包含1个小单拷贝区(SSC,19 218 bp),1个大单拷贝区(LSC,87 899 bp)和1对反向重复序列(IRa和IRb,26 378 bp);共注释到108个基因,包括76个蛋白编码基因,4个rRNA基因,28个tRNA基因;检测到47个简单重复序列(SSR)和48个
【机 构】
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南京林业大学生物与环境学院,南方现代林业协同创新中心,南京210037
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采用高通量测序技术分析了陕甘花楸(Sorbus koehneana)的叶绿体全基因组,并探讨其与爪瓣花楸(S.unguiculata)的关系.陕甘花楸叶绿体基因组全长159 873 bp,GC含量为36.60％,呈典型的四分体结构,包含1个小单拷贝区(SSC,19 218 bp),1个大单拷贝区(LSC,87 899 bp)和1对反向重复序列(IRa和IRb,26 378 bp);共注释到108个基因,包括76个蛋白编码基因,4个rRNA基因,28个tRNA基因;检测到47个简单重复序列(SSR)和48个分散重复序列(INE).花楸属植物叶绿体基因组在大小、基因类型、密码子、内含子和GC含量等方面高度保守,但不同的重复序列和位于非编码区的12个变异热点区域可用作后续物种遗传多样性和亲缘关系研究.系统发育分析结果显示陕甘花楸位于花楸属复叶亚属,与爪瓣花楸和钝齿花楸(S.helenae)亲缘关系较近;不支持将爪瓣花楸作为陕甘花楸的异名处理,建议恢复爪瓣花楸物种名称.
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