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当前厦门渔业发展正处在调整结构、实现增长方式转变的重要时期。加强厦门与台湾渔业交流与合作，对于加快厦门渔业产业结构调整，提升厦门对台经贸合作层次和水平，实现两岸渔业的深度合作，具有现实意义。根据厦门都市型渔业发展的定位，厦门对台渔业合作应该以休闲渔业、水产养殖和水产品加工业的交流合作、水产苗种合作研发和生产为主要选择。