目的:比较人乳头瘤病毒6型(HPV6)L1序列的变异,并筛选有代表性的分离标本进行重组HPV6L1蛋白的表达和抗原性检测。方法:根据不同临床特征选择主要致病型HPV6型8个分离标本,扩增L1基因,构建重组测序质粒。分析L1区的氨基酸序列变异状况,选择L1序列变异较大的临床分离标本,通过对HPV6L1基因的起始和终止端进行基因定点改造,连于表达载体质粒pET32a,在原核表达体系表达重组HPV6L1蛋白,并进行L1蛋白的抗原性检测。结果:HPV6型8个分离标本中有6个分离标本L1区的蛋白质一级结构中分别有1～3个氨基酸发生变异,原核表达重组L1蛋白可与HPV6L1抗体发生特异反应。说明HPV6L1序列的变异并未影响L1蛋白的抗原性。结论:本临床分离标本可提供发展HPV6L1蛋白和病毒样颗粒(VLP)疫苗的候选目的基因,并可通过原核表达体系表达重组HPVL1蛋白进行L1蛋白的免疫学分析,以及L1蛋白疫苗的研究。