应用生物信息学筛选前列腺癌潜在生物标志物

来源 :现代泌尿外科杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:ggg_0907
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目的 运用生物信息学方法筛选前列腺癌潜在生物标志物。 方法 从GEO数据库上下载编号为GSE55945的基因芯片数据集,使用R软件获取差异表达基因,然后通过蛋白互作网络等筛选出枢纽基因并进行初步验证。 结果 通过差异基因筛选,得到差异表达基因462个,其中上调基因114个,下调基因348个。基因本体功能富集分析显示差异表达基因主要参与肌肉系统、系统生物过程调节、循环系统等生物过程;京都基因与基因组百科全书通路富集分析显示这些差异表达基因主要涉及粘着斑、蛋白聚糖、cAMP信号通路及钙离子信号通路等通路
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