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石早3号由石家庄市农林科学研究院以sGK321为母本,矮早1号为父本,于2001年配制杂交组合,经过对其后代进行连续多年定向选择,南繁加代,抗病、虫鉴定,纤维品质测试和产量比较试验,于2010年选育而成。2012—2013年,该品系参加河北省夏直播区域试验,2014年5月通过河北省农作物品种审定委员会审定（审定编号“冀审棉2014013号”）。