目的了解沿海地区环境和人群中诺如病毒的污染状况,分析该病毒的传播路径。方法在2013年12月至2014年12月期间,定期逐月采集广东长沙湾牡蛎养殖区内的牡蛎、养殖水样本和沿岸居民的急性胃肠炎病例粪便或呕吐物样本。采用实时荧光定量RT-PCR与半巢式PCR相结合的方法检测诺如病毒,并采用Sanger法进行测序,绘制系统发育树。结果共检测331份牡蛎样本、110份养殖水样本和75份急性胃肠炎病例样本。牡蛎样本中诺如病毒阳性率为32.6%(108/331),养殖水样本中诺如病毒阳性率为11.8%(13/110),急性胃肠炎病例样本中诺如病毒阳性率为20.0%(15/75),牡蛎和养殖水样本冬春季诺如病毒阳性率高于夏秋季(P<0.05或P<0.01)。牡蛎中检出的诺如病毒基因型最多,共9种,病例和养殖水中分别检出5种和4种基因型。不同样本间存在相一致的基因型。从病例、牡蛎和养殖水样本中检出的诺如病毒均具有较高的序列一致度(95.8%~99.7%)。结论诺如病毒普遍流行于广东长沙湾养殖区内,持续存在且型别多样。诺如病毒在人群和环境中很可能存在循环传播路径,控制牡蛎养殖水域的诺如病毒污染对保障贝类产品的食品卫生十分必要。