木薯(Manihot esculenta)AKT1基因的克隆及生物信息学分析

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植物细胞中的K+通道蛋白AKT1 (Arabidopsis K+ transpoter 1)主要负责吸收K+.本研究基于木薯基因组数据库信息,利用PCR技术从木薯中克隆一个MeAKT1基因,该基因全长2 634 bp,编码877个氨基酸,生物信息学分析表明MeAKT1含有10个外显子和9个内含子,编码的氨基酸分子量为99.02 kD,等电点为8.43,属于稳定蛋白.MeAKT1包含有5个跨膜区域,N端含有1个Ion_ trans结构域,C端有1个KHA结构域,其二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主,进化树分析发现MeAKT1与蓖麻RcAKT1的亲缘关系最近.通过对MeAKT1蛋白的生物信息学分析有助于下一步深入研究MeAKT1在木薯耐贫瘠过程中的功能.
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