微小RNA-29a在肺结核患者血清中的表达及其生物学功能预测分析

来源 :中华结核和呼吸杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:applexiao
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的

分析微小RNA-29a(miR-29a)在肺结核患者血清中的表达,并对miR-29a的靶基因进行功能预测分析,为深入研究miR-29a与结核病感染调控机制的关系及其生物学功能奠定基础。

方法

病例组为未经治疗的活动性肺结核患者65例,对照组为健康志愿者45例,清晨空腹抽取静脉血,分离血清。用TRIzol试剂获取血清中总RNA,对RNA样本进一步纯化,通过紫外分光光度计和凝胶电泳检测RNA提取质量。用核酸杂交和荧光定量PCR检测miR-29a在血清中的表达。运用TargetScan与PicTar软件综合预测miR-29a的靶基因,取两者的交集作为靶基因。采用DAVID数据库对miR-29a预测的靶基因集合进行基因本体论(GO)注释描述分类,并分别提取GO的3类注释信息。采用网络调控分析软件Cytoscape中的插件BINGO进行GO注释的显著性分析。对靶基因集合进行生物通路富集分析。

结果

核酸杂交结果表明,病例组血清中miR-29a表达(854±93)显著高于对照组(80±22),差异有统计学意义(t=3.541,P<0.05)。荧光定量PCR结果表明,病例组血清中miR-29a表达(1.35±0.62)显著高于对照组(0.18±0.07),差异有统计学意义(t=2.987,P<0.05)。预测miR-29a的靶基因集合分别富集在转录调控等生物学过程、金属离子结合活性等分子功能及细胞外基质等细胞组分;miR-29a的靶基因集合显著富集于KEGG通路数据库中的黏附、细胞外基质受体相互作用等7个信号转导通路和Biocarta通路数据库中的整联蛋白信号通路、钙黏蛋白信号通路和Wnt信号通路等信号通路中。

结论

活动性肺结核患者血清中miR-29a表达显著上调,miR-29a的靶基因参与细胞黏附、转录调控等生物学过程。

其他文献
目的分析广水市2012年1月~2015年7月布鲁氏菌病流行病学特征,为防控工作提供科学依据。方法采用流行病学描述分析与个案调查的方法,回顾性收集、分析广水市2012年1月~2015年7
社区是社会构成的细胞,也是社会管理的神经末梢。2009年发生在乌鲁木齐的“7·5”分裂主义势力煽动、策划、制造的打砸抢烧杀暴力犯罪事件,更给这个社会管理的神经末梢提出了
在我们如今生活的这个时代,各种信息都会扑面而来。那么在我们日常生活当中这些信息的出现方式有很多是以图形的形式展现在我们眼前的。与此相关的便是计算机图像处理技术以及编程技术,这些技术的应用不仅仅在我们普通人的生活当中,在一些科研领域或是某些专业方面,都有应用到这两种技术。那么本篇文章的意义就是要对图像处理技术与编程技术进行简单的解释说明,并对此进行一定程度上的深入研究,具体体现在它们的应用方面上。
目的 探讨适宜课堂教学的参与式教学法.方法 在2006级护理专业妇产科护理学教学中,A班采用“课堂十分钟”教学法,B班采用传统的“讲授法”.课程结束后,采用自制问卷进行教师
深秋到江陵岑河,寻觅唐代诗人岑参的踪迹,只寻得一枝青葙。  “荆州的钱粮在江陵”,年少时读《三国演义》,一句话让我再忘不了江陵。如今核对原书,却是蔡瑁对曹操托出荆州家底时
期刊
化工企业的生产带来较大的经济效益,推动社会的进步.但不要忽视化工生产带来的安全问题,企业应该注重对化工安全的管理,增强工作人员的安全管理意识,提高管理水平,落实安全管
期刊
期刊
21世纪,基础教育课程改革的春风刮遍四面八方。“一切为了学生的发展”的观念日渐深入人心。当今新时代、适者生存,怎么培养人和培养什么样的人,成为班主任工作中最主要的研
期刊