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随着各类生物数据的加速增长,运用理论模型和数值计算研究生命科学的计算生物学和生物信息学已经成为最吸引人的新兴学科,是当今生命科学和自然科学的核心领域和最具活力的前沿领域之一.根据国际科技发展趋势和中国计算生物学的现状,中科院与德国马普学会于2004年5月共同签署了合作建设计算生物学伙伴研究所的合作意向书.2005年10月13日,中科院上海生命科学研究院计算生物学研究所(中科院-马普学会计算生物学伙伴研究所)正式揭牌.该所作为中国科学院下属的非法人研究单元,纳入中国科学院上海生命科学研究院管理序列.