【摘 要】
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核桃(Juglans regia L.)是新疆的重要经济树种.为研究'新温81'(W81)、'新温179'(W179)和'新萃丰'(X10)3个新疆核桃品种差异的遗传基础,我们对3种核桃仁的转录组进行了测序和
【机 构】
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浙江大学生物系统工程与食品学院,杭州,310058;塔里木大学植物科学学院,阿拉尔,843300
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核桃(Juglans regia L.)是新疆的重要经济树种.为研究'新温81'(W81)、'新温179'(W179)和'新萃丰'(X10)3个新疆核桃品种差异的遗传基础,我们对3种核桃仁的转录组进行了测序和分析.结果表明,所有样本与参考基因组比对后匹配率在93％以上,共有36 812个基因至少在六大数据库(NR,SwissProt,Pfam,COG,GO和KEGG)中一个数据库获得注释,占总基因数目的84.97％.分组比对显示,W81与X10、W81与W179、W179与X10间分别有1 921、2 058和1 253个差异表达基因.通过GO功能注释显示,3个品种差异基因在生物过程、细胞组分和分子功能3大类别均有分布,且分类结果相似.KEGG代谢通路富集分析表明,W81与W179,W81与X10间的差异基因主要富集在氨基酸代谢、脂肪酸合成与降解等代谢途径,W179与X10间仅在四条代谢途径有差异基因富集.本研究为培育优质核桃品种提供了科学依据.
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