基于RNA-Seq技术的犏牛囊胚冷冻前后单核苷酸多态性和可变剪切分析

来源 :实验动物与比较医学 | 被引量 : 0次 | 上传用户：ahdx2009

【摘要】

：

目的对犏牛囊胚玻璃化冷冻前后的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)和可变剪切(alternative splicing,AS)进行比较分析。方法采用普通娟珊牛精子和牦牛卵

【作者】

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郑杰张国忠胡艳梅伍学一杨宗富字向东

【机构】

：

攀枝花市妇幼保健院生殖医学中心,西南民族大学动物科学国家民委重点实验室

【出处】

：

实验动物与比较医学

【发表日期】

：

2020年4期

【关键词】

：

犏牛囊胚玻璃化冷冻转录组测序单核苷酸多态性可变剪切 Crossbred yakBlastocystVitrificationRNA-SeqSingle

【基金项目】

：

国家重点研发计划项目(2018YFD0502303)

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目的对犏牛囊胚玻璃化冷冻前后的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)和可变剪切(alternative splicing,AS)进行比较分析。方法采用普通娟珊牛精子和牦牛卵母细胞,以体外授精(in vitro fertilization,IVF)的方式获得犏牛囊胚。提取犏牛新鲜囊胚和经玻璃化冷冻复苏后的犏牛冻融囊胚总RNA,构建文库并进行高通量测序。采用SAMtools-0.1.19和ASprofile软件分别进行SNP和AS分析。结果犏牛新鲜囊胚和冻融囊胚

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