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近年来在四川、黑龙江和新疆等省、自治区发现眼子菜属一个新种，该新种因具异枝异叶，被命名为异枝眼子菜（新种）；其果具相同的背腹脊（棱）各一条；嘴小，背曲如钩；被片果时变厚硬而绿色；鲜果球形，干后果皮的在皮细胞呈多角形，而不同于属内其他种类。且生态变异幅度大，生丛密杂草之空隙中者，无浮泛叶，正常开花结果；生近岸波动之浅水中者，则通常不分枝。