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新型多苯并咪唑环芳识别氨基酸甲酯的分子动力学和密度泛函研究

来源 :成都电子机械高等专科学校学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：ljsamuel
【摘 要】
：
采用Gaussian03在B3LYP／6-31G（d）水平上分别优化新型多苯并咪唑环芳（MBICP）受体和氨基酸甲酯（AAME）配体，再用基于模拟退火的分子动力学方法CDOCKER将配体与受体对接，对每一个复合物获
【作 者】
：
娄永锋 肖蓉 向明礼 杨明理 
【机 构】
：
四川大学华西医院生物治疗国家重点实验室,四川大学华西医院纳米生物医学技术与膜生物学研究所,四川大学化工学院
【出 处】
：
成都电子机械高等专科学校学报
【发表日期】
：
2012年4期
【关键词】
：
咪唑环芳 分子动力学 密度泛函理论 分子识别 imidazole cyclophane molecular dynamics density functiona 
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采用Gaussian03在B3LYP／6-31G（d）水平上分别优化新型多苯并咪唑环芳（MBICP）受体和氨基酸甲酯（AAME）配体，再用基于模拟退火的分子动力学方法CDOCKER将配体与受体对接，对每一个复合物获得了一组最低能量的初始构象。最后用Turbomole在BLYP／def-TZVP水平对初始构象进一步优化，并对收敛后的复合物最低能量构象作NBO分析。以密度泛函理论计算获得的相互作用能作为核心参数，采用组合策略建立了表达MBICP-AAME复合物结合常数的定量关系模型，计算了该类复合物的结合常数
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