【摘 要】
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为分析2015年～2016年广东省猪流行性腹泻病毒(PEDV)流行株的遗传变异情况,本研究对16株广东地区的PEDV流行株部分S1基因进行克隆和测序,并将测序结果与GenBank中PEDV参考株S1
【机 构】
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佛山科学技术学院生命科学与工程学院
【基金项目】
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广东省现代农业科技创新联盟建设(2016LM1140);广东省科技计划项目(2015B02023006);国家自然科学基金青年科学基金项目(31502047)
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为分析2015年～2016年广东省猪流行性腹泻病毒(PEDV)流行株的遗传变异情况,本研究对16株广东地区的PEDV流行株部分S1基因进行克隆和测序,并将测序结果与GenBank中PEDV参考株S1基因进行同源性分析并构建系统进化树。结果显示,16株PEDV流行株核苷酸序列同源性为93.8%～100.0%,与国内参考株核苷酸序列同源性为70.7%~98.1%。PEDV S1基因遗传进化分析显示,16株流行株与国内大部分流行株亲缘关系较近,与疫苗株CV777、中国早期分离株CH/S、韩国流行株DR13、泰国流行株TH/AY/2.7/12、日本株14JM/01、美国株Minnesota/XW001等亲缘关系较远。此外,16株广东PEDV流行株与华南地区2014年之前分离株CH/GDQY/2011、CH9/FJ、CH/GDGZ/2012、FM/YN/2013等属群不同,亲缘关系较远。试验结果表明广东省当前流行的PEDV存在基因变异,并已经成为优势病毒株。
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