【摘 要】
:
目的 通过网络药理学和生物信息学挖掘并验证姜黄素抑制肾透明细胞癌增殖的作用机制.方法 从PharmMapper、GeneCards数据库筛选肾透明细胞癌和姜黄素共同靶点基因;应用TCGA数据库数据分析筛选出在肾透明细胞癌组织样本和正常组织样本中的差异表达并影响预后的共同靶点基因;利用STRING平台构建姜黄素-肾透明细胞癌靶点交互网络(protein-protein interaction,PPI);利用R软件对上述筛选靶点蛋白进行GO生物过程分析及KEGG通路富集分析;姜黄素和(或)活性氧抑制剂N-乙酰
【机 构】
:
西安交通大学第三附属医院,陕西省人民医院泌尿外科,陕西西安 710068;陕西省感染与免疫重点实验室,陕西西安 710068;西安市第四医院药剂科,陕西西安 710004;西安交通大学第三附属医院,陕
论文部分内容阅读
目的 通过网络药理学和生物信息学挖掘并验证姜黄素抑制肾透明细胞癌增殖的作用机制.方法 从PharmMapper、GeneCards数据库筛选肾透明细胞癌和姜黄素共同靶点基因;应用TCGA数据库数据分析筛选出在肾透明细胞癌组织样本和正常组织样本中的差异表达并影响预后的共同靶点基因;利用STRING平台构建姜黄素-肾透明细胞癌靶点交互网络(protein-protein interaction,PPI);利用R软件对上述筛选靶点蛋白进行GO生物过程分析及KEGG通路富集分析;姜黄素和(或)活性氧抑制剂N-乙酰基-L-半胱氨酸(N-acetyl-L-cysteine,NAC)作用于肾癌786-O、ACHN细胞后,通过CCK8检测不同浓度姜黄素对细胞增殖及细胞活力影响,通过活性氧检测试剂盒(2′,7′-dichlorodihydrofluorescein diacetate,DCFH-DA)检测细胞内活性氧水平,丙二醛(malondialdehyde,MDA)测定试剂盒测定细胞内MDA变化.结果 PharmMapper网站及GeneCards数据库筛选出姜黄素和肾癌共同靶点109个;TCGA数据库数据分析筛选出37个差异基因可能影响患者的总体生存期;PPI筛选出姜黄素抑制肾透明细胞癌生物学行为的核心靶标蛋白主要涉及CASP3、EGFR、CHEK1、HSP90AA1、AR等.GO富集分析确定213个条目,主要包括活性氧代谢过程、对类固醇激素的反应、纤维蛋白溶解等生物活性过程;KEGG富集分析确定24个条目,主要涉及丙酮酸代谢、糖酵解/糖异生、FoxO信号通路、大肠癌、酪氨酸代谢、IL-17信号通路、细胞凋亡等信号通路;姜黄素以时间和剂量依赖性方式降低了786-O、ACHN的细胞活力(P<0.05);姜黄素处理肾癌细胞后活性氧水平及MDA水平显著升高(P<0.05);加入NAC后逆转了姜黄素对786-O和ACHN细胞的细胞活力影响(P<0.05).结论 姜黄素可能参与氧化应激途径抑制肾细胞癌的增殖.
其他文献
目的 评价非抗反流型输尿管膀胱再植术治疗输尿管阴道瘘的有效性和安全性.方法 收集2008—2018年于四川大学华西医院就诊的80例输尿管阴道瘘患者的临床资料,均使用非抗反流型输尿管膀胱再植术进行治疗,即直接行输尿管及膀胱黏膜对黏膜吻合,不使用额外的抗反流手术措施.术后3月进行随访,评估患者临床症状,行尿液分析、泌尿系统超声及排泄性膀胱尿道造影,判断手术效果.结果 患者年龄(44.69±7.29)岁,体重指数22.56±2.49,术前漏尿时间(12.71±17.73)d.总体手术成功率为96.25%(77/
目的 验证Wnt信号通路在胃癌发生发展中的作用,建立胃癌Wnt信号通路相关基因预后模型,评价模型的预测价值.方法 下载TCGA胃癌基因转录数据和生存资料,使用GSEA富集分析方法验证Wnt信号通路在胃癌组织样品和癌旁样品富集情况.采用单因素COX回归分析和生存曲线分析初步筛选胃癌预后相关基因;使用多因素COX比例风险回归模型确定Wnt信号通路相关基因的预后模型;结合受试者工作特征曲线(receiver operating characteristic curve,ROC)和森林图验证该模型的临床预测价值;
目的:研究循证支持下针对性护理应用于雾化吸入治疗慢阻肺患者的意义.方法:从我院收治的慢阻肺患者中选取100例,采取随机数字表法,将其分为对照组(50例)和观察组(50例),选取时间控制在2018年10月至2020年10月之间,分别给予常规护理和循证支持下针对性护理,对比不同组别慢阻肺患者进行护理后的血氧和肺功能指标、生活质量评分、内心情绪状态、睡眠质量、护理满意度.结果:在对雾化吸入治疗慢阻肺患者进行护理后,观察组患者护理后的血氧和肺功能指标、生活质量评分、内心情绪状态、睡眠质量均好于对照组,且护理满意度
目的 筛选前列腺癌演变至去势抵抗阶段的危险因素,并探讨由前列腺穿刺病理学提示的神经侵犯在疾病进展中的意义.方法 回顾性分析2009年1月-2019年1月在新疆医科大学第一附属医院确诊并符合入排标准的416例前列腺癌患者的临床资料,使用Cox比例风险模型分析临床指标对去势抵抗性前列腺癌(CRPC)进展时间的影响,使用Kaplan-Meier生存分析和对数秩检验比较各组之间的差异;根据穿刺的病理结果,将纳入研究的病例分为有神经侵犯(PNIb)组和无PNIb组,组间进行卡方检验,多元Logistic回归分析PN
目的 对可能影响全国健康成年人中性粒细胞与淋巴细胞比值(neutrophil-to-lymphocyte ratio,NLR)参考值空间分异的影响因子进行筛选,探究在全国范围内NLR参考值的变化趋势.方法 收集全国62个城市的162681名健康成年人的NLR参考值,Spearman回归法分析NLR与25个地理因素二级指标的相关性,提取出9个具有显著相关关系的地理因素,构建随机森林模型,预测全国城市的健康成年人NLR参考值,并采用析取克里金的方法绘制全国健康成年人的NLR参考值地理分布图.结果 海拔、年日照
腹腔黏连是一种常见的腹部手术并发症,即使目前流行的腹腔镜手术也存在发生黏连的风险.腹腔黏连可引起慢性腹痛、肠梗阻、女性不育等严重问题.对于已经形成的黏连,只能采用二次手术(黏连松解术)机械剥离黏连组织,但若未经治疗仍然会引起黏连复发,复发率高达80%以上.
目的 分析肾脏黏液样小管状和梭形细胞癌(mucinous tubular and spindle cell carcinoma,MTSCC)的临床及病理学特点,探讨放射治疗在复发及转移难治性MTSCC中的局部治疗价值.方法 报道1例反复复发及转移的MTSCC病例,并回顾及分析目前关于MTSCC的相关文献,探讨放疗在复发转移MTSCC中的应用价值.结果 该患者经3次手术,术后病理均提示为肾脏黏液性小管状和梭形细胞癌,复发区域术后行放射治疗,该瘤床区域长期随访未再出现复发.结论 MTSCC是一种罕见的肾上皮肿
目的 探讨全面二胎政策下西安市新生儿出生体质量的影响因素,为孕产妇保健提供信息.方法 选取2018年5月—2019年11月在西安市西北妇女儿童医院分娩的产妇,收集产妇的社会人口学信息、妊娠及分娩信息,采用单因素分析、多因素线性回归等方法,分析全面二胎政策后产妇不同年龄、胎次下新生儿出生体质量的影响因素.结果 新生儿平均出生体质量为(3377±449)g,低出生体质量儿、巨大儿的发生率分别为7.4%、2.5%.多因素线性回归分析显示,分娩孕周(β=0.322,P<0.001)、新生儿性别(β=0.135,P
目的 基于数据挖掘及网络药理学,分析和挖掘中国知网(CNKI)平台期刊刊发的中药灌肠治疗慢性肾脏病(chronic kidney disease,CKD)有效中药处方的用药规律,寻找高频核心中药,预测核心中药的潜在靶点,以探讨核心中药治疗CKD的作用机制.方法 以CNKI为数据来源,检索中药灌肠治疗CKD的中医临床文献,采用SPSS Modeler 18.0统计软件,进行统计处理和关联规则分析,采用IBM SPSS Statistics 21统计软件进行聚类分析,应用BATMAN-TCM及TCMSP检索药
目的 评价不同消毒方法对新型冠状病毒核酸污染的清除能力,以获取最佳消毒方案.方法 分别使用医用棉拭子将50μL新型冠状病毒阳性质控品核酸均匀涂抹于塑料、金属、玻璃,晾干后分别滴加50μL 750 mL/L酒精(乙醇)、含氯消毒剂(2000、5500 mg/L)、PCR Cleaner,作用1 min后,使用医用棉拭子擦拭污染区后浸泡于300μL纯水中,震荡混匀后取5μL作为模板,实时荧光定量PCR(RT-qPCR)方法检测新型冠状病毒扩增靶区域ORF1ab和N基因及内标片段IC基因表达.并比较污染区经不同