目的探讨乙醛脱氢酶1A1(ALDH1A1)和乙醛脱氢酶6A1(ALDH6A1)在肝门部胆管癌组织中的表达及临床意义。方法收集东方肝胆外科医院2005年至2007年手术切除的49例肝门部胆管癌组织和10例配对的癌旁组织。采用免疫组化SP法检测上述组织中ALDH1A1和ALDH6A1的表达情况,分析两者表达与患者临床病理特征和预后的关系。结果在49例癌组织中,ALDH1A1和ALDH6A1蛋白的高表达率分别为69.4%(34/49)和44.9%(22/49),明显高于癌旁组织的30.0%(3/10)和10.0%(1/10)。ALDH1A1和ALDH6A1的表达与淋巴结转移有关(P<0.05),而与性别、年龄、TNM分期、肿瘤大小、浸润深度和神经侵犯无关(P>0.05)。ALDH1A1高表达者的中位无进展生存期(PFS)和中位总生存期(OS)均为12个月,明显短于低表达者的32个月和42个月,差异有统计学意义(P<0.05)。ALDH6A1高表达者的中位OS为16个月,短于低表达者的23个月,差异有统计学意义(P<0.05);ALDH6A1高表达者的中位PFS为15个月,短于低表达者的22个月,但差异无统计学意义(P>0.05)。Cox多因素分析显示,浸润深度和淋巴结转移是影响PFS的独立因素(P<0.05),浸润深度、淋巴结转移和ALDH1A1表达是影响OS的独立因素(P<0.05)。结论 ALDH1A1和ALDH6A1在肝门部胆管癌组织中表达增强,与肝门部胆管癌的发生、发展有关,ALDH1A1是评估预后潜在的肿瘤标志物。