【摘 要】
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WRKY转录因子在植物响应低温胁迫中发挥着重要的调控作用,但是甜瓜(Cucumis melo)WRKY基因家族的全基因组鉴定及其在低温胁迫下的表达模式分析报道较少.本研究对甜瓜WRKY基因
【机 构】
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甘肃农业大学园艺学院,兰州730070
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WRKY转录因子在植物响应低温胁迫中发挥着重要的调控作用,但是甜瓜(Cucumis melo)WRKY基因家族的全基因组鉴定及其在低温胁迫下的表达模式分析报道较少.本研究对甜瓜WRKY基因家族进行全基因组鉴定和生物信息学分析,并利用qRT-PCR技术检测WRKY基因在低温胁迫下的表达.结果 显示,甜瓜基因组中共鉴定出59个CmWRKYs,非均匀地分布在各条染色体;系统进化树分析发现,甜瓜WRKY成员被分成3大类群(Ⅰ～Ⅲ),第Ⅱ类群又被分成5个亚群(Ⅱa～e);共线性分析发现,甜瓜和拟南芥(Arabidopsis thaliana)WRKY基因家族之间存在28个共线基因对,CmWRKYs基因之间存在10个片段复制基因对;启动子分析发现,CmWRKYs启动子有多种与激素和逆境响应等相关的顺式调控元件;基因本体(Gene Ontology,GO)注释分析发现,CmWRKYs广泛参与生物过程、细胞成分和分子功能等生理过程;低温胁迫表达分析发现,11个CmWRKYs受低温胁迫显著上调表达.本研究结果可为后续CmWRKYs基因克隆和耐低温功能分析提供参考依据.
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