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经调查初步鉴定出蓬溪县赤城湖水库有指示藻类44种，隶属于6门、25属。其中极常出现在多污带水体的指示藻类2种，板常出现于α-中污带水体中的指示藻类15种，中污带板常出现的种类20种，微污带水体中板常出现的种类为7种。利用指示藻类和Margalef多样性指数分析表明，目前赤城湖水库的水质受到了一定的影响，通过严格管理和自来水厂的消毒、灭菌，从而保证居民生活的安全用水。