论文部分内容阅读
要精确计算水溶液中蛋白质分子的电子结构，必须将水对蛋白质电子结构的影响考虑进去．现利用第一性原理、全电子计算、从头计算，构造水溶液对苯丙氨酸（Phe）电子结构的等效势，这个等效势是由偶极子来模拟的，简单易用，可以方便地添加到蛋白质电子结构的第一性原理计算中．结果显示，由于水的存在，苯丙氨酸费米面附近八个能级平均上升约0．0379Ry，而这种水溶液对苯丙氨酸电子结构的影响可以很好地被我们所构建的偶极子势模拟．