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[摘 要] S-腺苷甲硫氨酸是广泛存在于生物体内的重要代谢中间物质,在体内参与DNA甲基化、蛋白质甲基化、多胺合成等众多的生物化学反应。在体内,S-腺苷甲硫氨酸合成酶催化ATP和甲硫氨酸(Met)形成S-腺苷甲硫氨酸。本文参考苏云金芽孢杆菌基因组中S-腺苷甲硫氨酸合成酶序列信息设计引物,通过PCR技术从芽孢杆菌属B.thuringiensis Dip20株菌中扩增得到SAM合成酶基因片段,插入大肠杆菌融合表达载体pGEX-6p-1构建了表达载体pGEX-SAM。将所构建的SAM合成酶表达载体pGEX-SAM转入大肠杆菌(Escherichia coli)DH5α 经IPTG诱导后,SDS-PAGE分析表明成功表达了SAM合成酶。进一步通过亲和层析成功的纯化了SAM合成酶。
[关键词] 克隆;表达;S-腺苷甲硫氨酸合成酶;亲和层析;蛋白纯化
一、研究意义
S-腺苷甲硫氨酸(SAM)是广泛存在于动物、植物和微生物体内的重要代谢中间物质,也是人体内一种重要的生理活性物质,参与了40多种生化反应。在生物体代谢网络中,S-腺苷甲硫氨酸的生物合成由S-腺苷甲硫氨酸合成酶[EC2.5.1.6]催化甲硫氨酸(Met)和ATP反应完成,即来自于ATP的腺苷部分攻击甲硫氨酸的硫原子,生成高能量、活泼的有机硫化合物,具有生物活性的(-)S-腺苷甲硫氨酸在体内主要起着转甲基、转硫、转氨丙基的作用。其中最主要的功能是作为甲基的供体参与甲基化作用,如蛋白质,核酸的甲基化等。同时在植物体内他还作为氨丙基的供体参与乙烯的合成。
二、材料与方法
1.菌株与质粒
大肠杆菌Escherichia coli DH5α,B.thuringiensis Dip20,质粒(plasmid)pGEX-6P-1,pGEX-SAM。
2.培养基及生化试剂
培养基:(1)LB(Luria- Bertani)培养基
质粒抽提试剂:(1)SolutionⅠ,(2)SolutionⅡ,(3)Solution Ⅲ(4)PBS缓冲液(pH7.4):(5)氨苄青霉素。限制性内切酶,PCR引物。
三、方法步骤
B.thuringiensis Dip20总DNA的提取:将B.thuringiensis Dip20接种于5mL LB培养基中,37℃、220 r/min培养16h以上。取培养物1.5mL离心收集菌体。加入567μLTE缓冲液,30μL 10%SDS,3μL蛋白酶K,混匀,37℃温浴1h。加入100μL5M NaCl,混匀,再加入80μL CTAB,混匀,70℃水浴10min。加入0.7倍体积的氯仿-异戊醇混匀。离心5min。转移上层亲水相,加入等体积苯酚-氯仿-异戊醇,离心5min。再将上层水相转移到新的离心管中,并加入0.6体积的异丙醇,冰上5min。然后12000r/min离心5min,沉淀重悬与50μLTE缓冲液中。加入1μL RNA酶,37℃作用15min。取5μL 0.7%琼脂糖凝胶电泳检测基因组提取结果。
PCR的基本反应步骤:(1)变性——将反应体系加热至95℃,使模板DNA完全变性成为单链,同时引物自身和引物之间存在的局部双链也得以消除;(2)退火(anneal)——将温度下降至适宜温度使引物与模板DNA退火结合;(3)延伸,将温度升至72℃,DNA聚合酶以dNTP为底物催化DNA的合成反应。
PCR产物纯化与酶切:将PCR扩增得到的PCR产物,通过0.7%琼脂糖凝胶电泳回收1200bp条带,DNA凝胶纯化试剂盒纯化PCR产物。纯化后的PCR产物以0.7%琼脂糖凝胶检测。纯化后的PCR产物进行与XhOⅠ双酶切。
pGEX-S-腺苷甲硫氨酸合成酶表达载体的构建:将经过BamHⅠ与XhoⅠ双酶切的pGEX-6p-1载体与PCR扩增片段按约3:1的摩尔混合,混勻后,4℃连接12h后转化大肠杆菌DH5α超级感受态,由于pGEX-6p-1有氨苄青霉素抗性,因此在含100μg/mL氨苄青霉素LB平板培养基上筛选阳性克隆。
感受态细胞的制备与酶物的连产转化:1﹒取保存的菌接种于LB固体培养基,37°C培养过夜(不超16h)。2﹒挑取单菌落至5mLLB液体培养基,37°C,200r/min培养过夜。3﹒按1:100取1mL培养菌液转入100mL LB液体培养基中,37℃,250r/min培养至OD600=0.3至0.4,立刻置于冰上10min(冰上操作要轻柔,避免较大的振荡)。4﹒4000rpm离心5min去上清,加入2.5mL 0.1M Mg2SO4溶液,悬浮沉淀,冰浴15min。5﹒4000rpm离心5min,去上清,加入2.5mL 0.1M CaCl2及15%甘油,悬浮沉淀。6﹒以200ul每管分装,-70C保存备用。
转化:1﹒取上述制备的感受态一只200ul。2﹒加入酶连产物10ul,轻轻摇匀。冰上放置30min。3﹒42℃水浴热击90s,冰上放置3min。4﹒加入1mL LB液体培养基(不含Ap+),混匀37℃摇床(200 rpm)复苏1h。5﹒取500ul菌液涂含有Ap+的LB培养基平板,正面放置待完全吸收变干后在37℃倒置培养过夜。
S-腺苷甲硫氨酸合成酶诱导表达:从转化的大肠杆菌中挑取单个菌落,接种于A+(终浓度为50ug/mL)的10mL LB的50mL的离心管中,放置37℃恒温摇床中,200r/min培养过夜。2.按1%比例接入到1000mL 含A+(终浓度为50ug/mL)的LB培养液中。在37℃和200r/min条件下培养。3.培养2h后测OD600值,当OD600≈0.8时加入终浓度为0.5mol/ITPG诱导表达,经过28℃,200r/min摇床诱导三小时。4﹒将诱导后的培养液分装到4个250mL的离心管中,于4℃4000r/min离心10min。5﹒到掉上层培养液,用PBS洗沉淀菌体,打散混匀。在4℃4000r/min离心10min。再重复一次。6.收集4只离心管中菌体,保存4℃条件下保存备用。 S-腺苷甲硫氨酸合成酶的纯化:将收集到的菌体PBS(pH7.4,50mL)缓冲液重悬,以2000psi.破碎细胞。破碎液以15000 r/min离心15min,取上清。所有操作在冰上进行。取1mLSepharose 4B于纯化柱内,以PBS(pH7.4)缓冲液平衡柱床。将上述上清液加样于柱内,以PBS(pH7.4)缓冲液洗涤柱床4h,将柱内液面与柱床齐平,加入蛋白酶3C(用前用PBS)缓冲液稀释,过夜。然后加入2mLPBS4(pH7.4,50mL)缓冲液,收集洗脱液,即为含目的蛋白溶液。所有操作于4℃进行。纯化的蛋白经过10% SDS-PAGE电泳,考马斯蓝染色检测。
四、讨论
1.为了提高转化效率,实验中要考虑以下四个重要因素
(1)细胞生长状态和密度:不要用经过多次转接或储于4℃的培养菌,最好直接用–70℃或–20℃甘油保存的菌种制备感受态细胞的菌液。细胞生长密度以刚进入对数生长期时为好,可通过监测培养液的OD600来控制。DH5α菌株的OD600为0.5时,细胞密度在5×107 个/mL左右,这时比较合适。密度过高或不足均会影响转化效率。
(2)质粒的质量和浓度:用于转化的质粒DNA应主要是超螺旋态DNA。转化效率与外源DNA的浓度在一定范围内成正比,但当加入的外源DNA的量过多或体积过大时,转化效率就会降低。一般情况下,DNA溶液的体积不应超过感受态细胞体积的5%。
(3)试剂的质量:所用的试剂如 CaCl2等均需是最高纯度的(GR.或AR.),并用超纯水配制,最好分装保存于干燥的冷暗处。
(4)防止杂菌和杂DNA的污染:整个操作过程均应在无菌条件下进行,所用器皿,如离心管,tip头等最好是新的,并经高压灭菌处理,所有的试剂都要灭菌,且注意防止被其他试剂、DNA酶或杂DNA所污染,否则均会影响转化效率或杂DNA的转入,为以后的筛选、鉴定带来不必要的麻烦。
2.纯化蛋白方法的选择
纯化蛋白方法的选择要从几个方面考虑。首先是纯化效率,通过几种纯化方法的比较,要想得到高纯度的蛋白最好采用亲和层析来纯化蛋白;其次是费用问题,相对来说亲和层析比一般蛋白纯化方法贵,如本体积较大就不宜采取亲和层析,本实验中收集到的菌体事先通过破碎细胞、离心,对SAM合成酶蛋白进行了粗分离。此时收集的上清体积不大,且大部分雜质在上粗分离已经除去,可采用亲和层析。最后亲和层析方法简便,易于操作。
参考文献
[1] 王学奎.植物生理生化实验原理与技术.北京:科学出版社.2006
[2] 王金霞,谭海东,赵宗保.大肠杆菌K12苹果酸酶的克隆、表达与纯化.生物加工过程.2006,2(4):35~38
[3] 王晓玲,叶林柏等.HCVNS4基因在大肠杆菌中表达及蛋白质提纯.武汉大学学报.2001,147(14):468~470
[4] 王友如.大肠杆菌质粒DNA提取方法的优化.生物技术.2006,116(16):42~44
[5] 李杨,韩梅.亲和层析技术在生物科学中的应用及发展.生命科学研究,2006,10(1):12~16
[6] 李洪利,黄周丽.亲和层析技术在现代蛋白质.海洋湖沼通报.2005,(3):86~92
[7] 向左云,郑颖等.蛋白质凝胶过滤色谱上样方法的改进.生物技术通讯.2002,13(1):38-41
[8] 许亚平,林俊岳.蛋白质提纯研究进展.天津化工.2006,7(20):9-11
[9] 余志良,蔡谨,袁中一.S-腺苷甲硫氨酸的研究进展.中国医药工业杂志.2003,3(1):49~52
[10] 苏昕,阎浩林,梁丽莉.酵母SOD分离纯化及其酶学性质的研究.沈阳药科大学学报.2005,122(11):167
[11] 苏俊,张国政,刘忠华.蛋白质在分离纯化中保持稳定的方法及应用.天津轻工业学院学报.2002,3(1):21~24
[关键词] 克隆;表达;S-腺苷甲硫氨酸合成酶;亲和层析;蛋白纯化
一、研究意义
S-腺苷甲硫氨酸(SAM)是广泛存在于动物、植物和微生物体内的重要代谢中间物质,也是人体内一种重要的生理活性物质,参与了40多种生化反应。在生物体代谢网络中,S-腺苷甲硫氨酸的生物合成由S-腺苷甲硫氨酸合成酶[EC2.5.1.6]催化甲硫氨酸(Met)和ATP反应完成,即来自于ATP的腺苷部分攻击甲硫氨酸的硫原子,生成高能量、活泼的有机硫化合物,具有生物活性的(-)S-腺苷甲硫氨酸在体内主要起着转甲基、转硫、转氨丙基的作用。其中最主要的功能是作为甲基的供体参与甲基化作用,如蛋白质,核酸的甲基化等。同时在植物体内他还作为氨丙基的供体参与乙烯的合成。
二、材料与方法
1.菌株与质粒
大肠杆菌Escherichia coli DH5α,B.thuringiensis Dip20,质粒(plasmid)pGEX-6P-1,pGEX-SAM。
2.培养基及生化试剂
培养基:(1)LB(Luria- Bertani)培养基
质粒抽提试剂:(1)SolutionⅠ,(2)SolutionⅡ,(3)Solution Ⅲ(4)PBS缓冲液(pH7.4):(5)氨苄青霉素。限制性内切酶,PCR引物。
三、方法步骤
B.thuringiensis Dip20总DNA的提取:将B.thuringiensis Dip20接种于5mL LB培养基中,37℃、220 r/min培养16h以上。取培养物1.5mL离心收集菌体。加入567μLTE缓冲液,30μL 10%SDS,3μL蛋白酶K,混匀,37℃温浴1h。加入100μL5M NaCl,混匀,再加入80μL CTAB,混匀,70℃水浴10min。加入0.7倍体积的氯仿-异戊醇混匀。离心5min。转移上层亲水相,加入等体积苯酚-氯仿-异戊醇,离心5min。再将上层水相转移到新的离心管中,并加入0.6体积的异丙醇,冰上5min。然后12000r/min离心5min,沉淀重悬与50μLTE缓冲液中。加入1μL RNA酶,37℃作用15min。取5μL 0.7%琼脂糖凝胶电泳检测基因组提取结果。
PCR的基本反应步骤:(1)变性——将反应体系加热至95℃,使模板DNA完全变性成为单链,同时引物自身和引物之间存在的局部双链也得以消除;(2)退火(anneal)——将温度下降至适宜温度使引物与模板DNA退火结合;(3)延伸,将温度升至72℃,DNA聚合酶以dNTP为底物催化DNA的合成反应。
PCR产物纯化与酶切:将PCR扩增得到的PCR产物,通过0.7%琼脂糖凝胶电泳回收1200bp条带,DNA凝胶纯化试剂盒纯化PCR产物。纯化后的PCR产物以0.7%琼脂糖凝胶检测。纯化后的PCR产物进行与XhOⅠ双酶切。
pGEX-S-腺苷甲硫氨酸合成酶表达载体的构建:将经过BamHⅠ与XhoⅠ双酶切的pGEX-6p-1载体与PCR扩增片段按约3:1的摩尔混合,混勻后,4℃连接12h后转化大肠杆菌DH5α超级感受态,由于pGEX-6p-1有氨苄青霉素抗性,因此在含100μg/mL氨苄青霉素LB平板培养基上筛选阳性克隆。
感受态细胞的制备与酶物的连产转化:1﹒取保存的菌接种于LB固体培养基,37°C培养过夜(不超16h)。2﹒挑取单菌落至5mLLB液体培养基,37°C,200r/min培养过夜。3﹒按1:100取1mL培养菌液转入100mL LB液体培养基中,37℃,250r/min培养至OD600=0.3至0.4,立刻置于冰上10min(冰上操作要轻柔,避免较大的振荡)。4﹒4000rpm离心5min去上清,加入2.5mL 0.1M Mg2SO4溶液,悬浮沉淀,冰浴15min。5﹒4000rpm离心5min,去上清,加入2.5mL 0.1M CaCl2及15%甘油,悬浮沉淀。6﹒以200ul每管分装,-70C保存备用。
转化:1﹒取上述制备的感受态一只200ul。2﹒加入酶连产物10ul,轻轻摇匀。冰上放置30min。3﹒42℃水浴热击90s,冰上放置3min。4﹒加入1mL LB液体培养基(不含Ap+),混匀37℃摇床(200 rpm)复苏1h。5﹒取500ul菌液涂含有Ap+的LB培养基平板,正面放置待完全吸收变干后在37℃倒置培养过夜。
S-腺苷甲硫氨酸合成酶诱导表达:从转化的大肠杆菌中挑取单个菌落,接种于A+(终浓度为50ug/mL)的10mL LB的50mL的离心管中,放置37℃恒温摇床中,200r/min培养过夜。2.按1%比例接入到1000mL 含A+(终浓度为50ug/mL)的LB培养液中。在37℃和200r/min条件下培养。3.培养2h后测OD600值,当OD600≈0.8时加入终浓度为0.5mol/ITPG诱导表达,经过28℃,200r/min摇床诱导三小时。4﹒将诱导后的培养液分装到4个250mL的离心管中,于4℃4000r/min离心10min。5﹒到掉上层培养液,用PBS洗沉淀菌体,打散混匀。在4℃4000r/min离心10min。再重复一次。6.收集4只离心管中菌体,保存4℃条件下保存备用。 S-腺苷甲硫氨酸合成酶的纯化:将收集到的菌体PBS(pH7.4,50mL)缓冲液重悬,以2000psi.破碎细胞。破碎液以15000 r/min离心15min,取上清。所有操作在冰上进行。取1mLSepharose 4B于纯化柱内,以PBS(pH7.4)缓冲液平衡柱床。将上述上清液加样于柱内,以PBS(pH7.4)缓冲液洗涤柱床4h,将柱内液面与柱床齐平,加入蛋白酶3C(用前用PBS)缓冲液稀释,过夜。然后加入2mLPBS4(pH7.4,50mL)缓冲液,收集洗脱液,即为含目的蛋白溶液。所有操作于4℃进行。纯化的蛋白经过10% SDS-PAGE电泳,考马斯蓝染色检测。
四、讨论
1.为了提高转化效率,实验中要考虑以下四个重要因素
(1)细胞生长状态和密度:不要用经过多次转接或储于4℃的培养菌,最好直接用–70℃或–20℃甘油保存的菌种制备感受态细胞的菌液。细胞生长密度以刚进入对数生长期时为好,可通过监测培养液的OD600来控制。DH5α菌株的OD600为0.5时,细胞密度在5×107 个/mL左右,这时比较合适。密度过高或不足均会影响转化效率。
(2)质粒的质量和浓度:用于转化的质粒DNA应主要是超螺旋态DNA。转化效率与外源DNA的浓度在一定范围内成正比,但当加入的外源DNA的量过多或体积过大时,转化效率就会降低。一般情况下,DNA溶液的体积不应超过感受态细胞体积的5%。
(3)试剂的质量:所用的试剂如 CaCl2等均需是最高纯度的(GR.或AR.),并用超纯水配制,最好分装保存于干燥的冷暗处。
(4)防止杂菌和杂DNA的污染:整个操作过程均应在无菌条件下进行,所用器皿,如离心管,tip头等最好是新的,并经高压灭菌处理,所有的试剂都要灭菌,且注意防止被其他试剂、DNA酶或杂DNA所污染,否则均会影响转化效率或杂DNA的转入,为以后的筛选、鉴定带来不必要的麻烦。
2.纯化蛋白方法的选择
纯化蛋白方法的选择要从几个方面考虑。首先是纯化效率,通过几种纯化方法的比较,要想得到高纯度的蛋白最好采用亲和层析来纯化蛋白;其次是费用问题,相对来说亲和层析比一般蛋白纯化方法贵,如本体积较大就不宜采取亲和层析,本实验中收集到的菌体事先通过破碎细胞、离心,对SAM合成酶蛋白进行了粗分离。此时收集的上清体积不大,且大部分雜质在上粗分离已经除去,可采用亲和层析。最后亲和层析方法简便,易于操作。
参考文献
[1] 王学奎.植物生理生化实验原理与技术.北京:科学出版社.2006
[2] 王金霞,谭海东,赵宗保.大肠杆菌K12苹果酸酶的克隆、表达与纯化.生物加工过程.2006,2(4):35~38
[3] 王晓玲,叶林柏等.HCVNS4基因在大肠杆菌中表达及蛋白质提纯.武汉大学学报.2001,147(14):468~470
[4] 王友如.大肠杆菌质粒DNA提取方法的优化.生物技术.2006,116(16):42~44
[5] 李杨,韩梅.亲和层析技术在生物科学中的应用及发展.生命科学研究,2006,10(1):12~16
[6] 李洪利,黄周丽.亲和层析技术在现代蛋白质.海洋湖沼通报.2005,(3):86~92
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[10] 苏昕,阎浩林,梁丽莉.酵母SOD分离纯化及其酶学性质的研究.沈阳药科大学学报.2005,122(11):167
[11] 苏俊,张国政,刘忠华.蛋白质在分离纯化中保持稳定的方法及应用.天津轻工业学院学报.2002,3(1):21~24