转录组测序评价烤烟N导入片段近等基因系的连锁累赘

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为了从全基因组表达角度了解短N导入片段降低烤烟抗性连锁累赘的效果,对近等基因系打顶后35 d上部第3片叶进行了转录组测序及生物信息学分析。结果表明:与对照‘云烟87’(‘Y87’)相比,长N导入片段近等基因系(‘Y87NL’)的上调表达、下调表达基因数量最多,分别为3 183和2 925个。短N导入片段近等基因系(‘Y87NS2’, ‘Y87NS5’)的差异表达基因数量比‘Y87NL’减少33.0%~56.8%。‘Y87NL’的上调表达、下调表达lncRNA数量最多,分别为1 406和1 785个。短N导入片段近等基因系的差异表达lncRNA数量比‘Y87NL’减少26.6%~46.3%。差异表达基因类型与数量、代谢通路富集分析表明:短N导入片段近等基因系在取样时间点的全基因组表达情况比‘Y87NL’更加类似‘云烟87’,短N导入片段降低了长N导入片段对‘云烟87’基因表达的扰动。综合成熟期上部叶转录组测序分析结果,短N导入片段近等基因系降低了连锁累赘。本研究结果可为短N导入片段近等基因系的育种利用提供参考依据。
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