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在绩效工资改革中，工作量绩效奖励、超工作量、教学与科研工作量计算等问题引人关注。绩效工资分配存在的主要难点在于如何兼顾过程与目标激励、如何平衡教学与科研、如何协调基础课与专业课。高校绩效评价应结合岗位要求和过程表现综合考虑，并根据学科特点调整相应比例，真正体现高校分级分类管理的收入分配导向，通过采用综合过程评价和岗位考核的过渡方案、明确不同岗位的教学和科研基本工作量、制定统一的教学工作量计算办法等，实现高校绩效工资二次分配的科学性、公平性、合理性。