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为筛选影响芽黄现象的差异表达蛋白，采用双向电泳一质谱技术研究黄瓜芽黄突变体与正常黄瓜的蛋白表达差异。提取相同生长时期的芽黄突变体黄瓜yh与正常黄瓜的叶片组织的总蛋白，进行双向凝胶电泳，其结果应用PDQuest软件分析。共选取22个蛋白进行MALDI-TOF质谱分析，结果表明，22个蛋白中芽黄突变体中上调表达的有7个，正常黄瓜中上调表达的有6个，无明显差异的蛋白9个。本实验成功建立了黄瓜芽黄突变体双向电泳分析体系，并筛选出差异蛋白，为黄化突变体分子机制研究奠定了一定基础。