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MEDLINEP数据库的检索主要通过PubMed和光盘。为了比较两者检索同一课题的检索结果的差异，选取了三组不同类型提问词分别对两者进行检索。结果表明，对不同类型提问词的检索，PubMed中检出文献均高于光盘，尤其是自由词的检索。主要原因有三个：PubMed的MEDLINEP数据库本身所含记录更多、更新更快，PubMed具有主题词自动扩展检索功能和自由词自动转换功能。