斜纹夜蛾核多角体病毒 (SpltNPV)基因组4 .73kb片段的序列分析

来源 :生物化学与生物物理学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:ylm1982123
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报道了斜纹夜蛾核多角体病毒 (Spodopteralituranucleopolyhedrovirus ,SpltNPV)基因组EcoRI E片段中长 4730bp的序列分析结果。该序列上含有完整的SpltNPVodv e6 6基因 ,一个开放读码框ORF 10 86 (AcMNPVORF10 9的同源区 )和一个类似亮氨酸拉链蛋白的基因 (命名为 p34基因 )。序列比较分析表明 ,SpltNPVodv e6 6基因编码区全长 2 0 79bp ,编码一种 6 92aa的蛋白质 ,其起始密码子ATG上游只有一个常见的晚期基因启动子模体 (motif)ATAAG而基因的下游无典型的poly(A)加尾信号。SpltNPVODV E6 6蛋白质的氨基酸序列与LdMN PV、LsNPV、AcMNPV、BmNPV、CfNPV、OpMNPVODV E6 6蛋白质具有四个高度保守的区域 ,其上含有一推断的核定位信号KKIWAEDGR。odv e6 6基因上游的ORF与其同向不同框 ,5′端除有CAAT盒 ,还发现有典型的杆状病毒早期基因启动子元件ACGT和GC单元以及晚期基因的转录起始核心序列TTAAG。预测的ORF产物为2 89个氨基酸 ,分子量为 33771的蛋白质 ,故命名为P34蛋白。SpltNPVP34蛋白的C端和N端分别有一个亮氨酸拉链结构和类亮氨酸拉链结构。SpltNPV p34基因的调控元件可能具有重要功能。odv e6 6基因 3′端 5 14nt处的ORF 10 86方向与odv e6 6基因相反 ,能编码一种 36 1aa的多肽。ORF 10 86蛋白质氨基
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