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【目的】采用分子生物学方法鉴定1个五步蛇（Deinagkistrodon acutus）源隐孢子虫分离株,了解中国蛇隐孢子虫感染的种类分布。【方法】利用巢式PCR方法,扩增隐孢子虫18S rRNA基因特异性片段,对PCR产物进行限制性片段长度多态性分析（PCR-RFLP）和同源性分析,构建其种系发育进化树。【结果】成功扩增出18S rRNA基因目的片段,PCR产物经SspⅠ酶消化后获得的酶切结果和先前报道的蛇隐孢子虫（Cryptosporidium serpentis）一致。获得的840 bp 18S r