多因子降维法在评价代谢酶基因-基因-环境交互作用中的应用

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目的探讨如何用多因子降维法(multifactor dimensionality reduction,MDR)分析人群肺癌发病风险的基因-基因-环境间交互作用。方法收集500例肺癌确诊患者和517例非肺癌对照个体的16种代谢酶基因65个位点单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)资料及主要的环境因素(性别、年龄、吸烟状况、烟龄、吸烟量和肿瘤家族史)暴露情况,在遗传平衡(Hardy-Weinberg equilibrium,HWE)的基础上,采用MDR分析其基因-基因及基因-环境间的交互效应。结果该资料符合HWE(P=0.238~0.937);多环芳烃受体基因(aryl hydrocarbon acceptor,AhR)rs2158041位点和乙醛脱氢酶2基因(aldehyde dehydrogenase 2,ALDH2)rs4646782位点杂合型及烟龄较长等交互组合的"高危"人群是非上述组合的"低危"人群肺癌发病风险的2.639倍(OR=2.639,95%CI:2.047~3.403)。结论 rs2158041、rs4646782、烟龄三因素在肺癌发病中具有显著的交互效应,可增加1.639倍发病风险。MDR法在分析疾病基因-基因-环境交互作用中切实可行,具有较好的应用前景。
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