黄鳝主要组织相容性复合体Ⅰα基因的克隆及多态性分析

来源 :湖南农业大学学报(自然科学版) | 被引量 : 0次 | 上传用户:jxgalcj
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通过同源克隆,结合RACE技术,从黄鳝肝脏cDNA中分离得到了MHCⅠα基因的全长cDNA序列.结果表明:黄鳝MHCⅠα基因cDNA全长1 731 bp,5'UTR长78bp,3'UTR长600 bp,编码1条350个氨基酸的多肽;与其他鱼类不同,黄鳝Ⅰα基因只具有4个外显子和3个内含子.二级结构分析结果表明,该基因具有MHⅠα基因的典型特征和保守区域.实时荧光定量PCR检测结果表明:黄鳝MHCⅠα基因在不同组织中表达量的差别较大;嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophilia)感染可显著影响黄鳝肝脏、肾脏和脾脏MHC Ⅰα基因的表达.对42个个体MHC Ⅰα基因外显子3序列的测定结果表明,42个个体共分离到50个等位基因,每个个体包含1~6个等位基因,推测黄鳝具有至少3个Ⅰα基因座位;等位基因PBR位点和非PBR位点的dN值均显著大于ds(P<0.05),提示黄鳝Ⅰα基因曾经历过强烈的正选择作用.
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