添加二级结构作为特征来对抗癌肽进行预测

来源 :生物物理学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zhangfegnlin
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抗癌肽是一种具有明显抗肿瘤活性的抗微生物肽,抗癌肽不仅能快速高效地消灭致病病菌,还能有效地作用于人体肿瘤细胞。本文将已发表文献的抗癌肽数据集中,首次提取了蛋白质3种二级结构组分(3PSS)作为特征参量,并结合20种氨基酸组分(20AAC)和6种亲疏水氨基酸组分(6HP)作为特征信息,并采用二次判别法(QD)实施预测。最后,在7折交叉检验下,当采用蛋白质3种二级结构组分(3PSS)结合6种亲疏水氨基酸组分(6HP)作为特征时,预测总精度(Acc)达到86%;当采用蛋白质3种二级结构组分(3PSS)结合20种
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