【摘 要】
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目的 胰腺癌是恶性腹部肿瘤,以5年生存率奇低,致死率非常高为特征.文章基于生物信息学方法挖掘生物医学数据库数据,识别Ikarugamycin(斑鸠霉素)作用于胰腺导管腺癌(PDAC)的潜在靶标基因.方法 从基因表达汇编(GEO)数据库中下载数据集GSE120713,通过R软件对数据进行校正并鉴定差异表达基因(DEGs),绘制火山图和热图,并对鉴定出的DEGs进行GO富集分析和KEGG信号通路富集分析.然后,利用STRING网站和Cytoscape软件对DEGs进行蛋白质相互作用分析,借助Cytohubba
【机 构】
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110000 沈阳,中国医科大学附属盛京医院普通外科
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目的 胰腺癌是恶性腹部肿瘤,以5年生存率奇低,致死率非常高为特征.文章基于生物信息学方法挖掘生物医学数据库数据,识别Ikarugamycin(斑鸠霉素)作用于胰腺导管腺癌(PDAC)的潜在靶标基因.方法 从基因表达汇编(GEO)数据库中下载数据集GSE120713,通过R软件对数据进行校正并鉴定差异表达基因(DEGs),绘制火山图和热图,并对鉴定出的DEGs进行GO富集分析和KEGG信号通路富集分析.然后,利用STRING网站和Cytoscape软件对DEGs进行蛋白质相互作用分析,借助Cytohubba插件识别出10个hub基因.最后,分别在GEPIA2和Kaplan-Meier Plotter网站上验证这些hub基因的表达及预后情况.结果 GEPIA2和Kaplan-Meier Plotter的结果提示:DDIT3、GADD45A、LOX、MMP1、SERPINE1和TXNIP同时满足在PC中表达及预后均有统计学意义,被确定为hub基因.结论 斑鸠霉素可能通过下调DDIT3或LOX的表达,参与PANC-1细胞系糖酵解过程,从而发挥对PANC-1细胞的抑制作用,该研究有助于发现斑鸠霉素治疗PDAC的潜在机制.
其他文献
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目的 磷酸二酯酶9A(PDE9A)在缺血缺氧再灌注中的作用尚不明确.文中旨在探讨PDE9A对缺血缺氧再灌注所致乳鼠心肌细胞的作用.方法 培养原代乳鼠的心肌细胞鉴定后,采用氧糖剥夺/再灌注法(OGD/R)构建心肌细胞缺氧的模型;磷酸二酯酶9A(PDE9A)的干扰质粒转染入OGD/R细胞,并向细胞中分别加入可溶性鸟苷酸环化酶(sGC)和受体型鸟苷酸环化酶(rGC)的抑制剂处理.实验分为对照组(心肌细胞不干预)、OGD/R组(构建心肌OGD/R模型)、siPDE9A组(构建PDE9A的干扰质粒转染OGD/R细胞
目的 目前感染后闭塞性细支气管炎(PIBO)治疗后临床转归情况尚不明确.文中旨在研究儿童腺病毒PIBO的临床转归情况.方法 收集2019年2月至2019年8月因罹患腺病毒肺炎在南京医科大学附属儿童医院呼吸科和感染科住院并在呼吸科的随访中确诊为PIBO的26例患儿作为研究对象.分别记录其确诊时、确诊后6个月、12个月、18个月和24个月时临床表现、胸部高分辨率CT(HRCT)、肺功能和生长发育的变化.结果 随访6个月、12个月、18个月和24个月时,分别有46.2％、76.9％、76.9％和80.8％的患儿
目的 体重异常能够增加ccRCC发病的风险.文中探讨体重异常与ccRCC临床分期、病理分级的相关性.方法 回顾性分析2014年1月至2020年7月于解放军联勤保障部队第九〇一医院就诊的97例ccRCC患者临床病理资料,以291例健康体检者作对照组,比较2组人群在吸烟、高血压、糖尿病、体质异常(BMI≥25 kg/m2)等差异.通过Logistics回归法分析高血压、糖尿病、体质异常与ccRCC的关系.将97例ccRCC患者分为非超重组、超重组和肥胖组,比较三组患者在临床分期及病理分级资料的差异. 结果 肾
目的 C1GALT1已被报道在多种癌症中呈现高表达,miR-199b-5p对肿瘤的发生有抑制作用,但在胃癌中的作用机制尚不明确.文章旨在探讨miR-199b-5p通过调控C1GALT1对胃癌BGC-823细胞增殖、迁移和侵袭影响.方法 利用生物信息学分析C1GALT1在胃癌中的表达情况.细胞进行分组①SiRNA转染:空白对照组1、Si-NC组、Si组(3、5、8μM);②双荧光素酶实验分组:MI-NC+h-C1GALT1-3UTR-wt组、MI+h-C1GALT1-3UTR-wt组、MI-NC+h-C1G
目的 单侧双通道内镜技术治疗腰椎管狭窄症是近年来新兴的微创方式.文中旨在探讨单侧双通道脊柱内镜技术(UBE)治疗腰椎管狭窄症的临床疗效.方法 回顾性分析2020年1月至12月东部战区总医院骨科收治的30例腰椎管狭窄症患者临床资料.所有患者均行UBE,通过记录患者手术时间、出血量、术后引流量等评估其安全性.比较术前、术后3天、术后3个月、术后6个月腰痛及下肢痛的视觉模拟评分(VAS)和Oswestry功能障碍指(ODI)以及改良的Macnab标准评估其临床疗效.结果 所有腰椎管狭窄症患者均在镜下顺利完成手术
目的 目前有关凝血功能指标与肝硬化患者肝脏储备功能关系的研究鲜有报道,文中旨在分析其间关系,并进一步了解凝血功能指标对上消化道大出血的预测价值. 方法 回顾性分析2020年4月至2021年6月期间上海交通大学附属苏州九龙医院收治的81例肝硬化患者(肝硬化组)以及50例慢性肝病患者(对照组)临床资料.同时,根据Child?Tureotte?Pugh(CTP)评分分级、MELD评分和近期是否出现上消化道大出血对肝硬化患者进行分组,检测并比较各组凝血功能指标,包括凝血酶原时间(PT)、凝血酶时间(TT)、活化部
目的 赖氨酰氧化酶样蛋白1(LOXL1)和赖氨酰氧化酶样蛋白2(LOXL2)在恶性胸膜间皮瘤(MPM)的表达差异及其预后价值尚不明确.文中旨在探讨LOXL1和LOXL2基因mRNA在MPM组织中的表达及其临床意义.方法 回顾性收集2017年6月至2019年12月大理大学第一附属医院胸外科12例MPM患者的癌组织和配对相邻正常胸膜组织.采用RT-qPCR检测MPM组织及配对正常胸膜组织中LOXL1和LOXL2基因mRNA表达量.通过Oncomine数据库对非瘤组织与MPM组织中LOXL1和LOXL2基因的表
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