长期以来，科研单位的资金来源主要靠国家财政拨款，财务管理主要是实行财政预算管理，“拨款——支付——核销”，纯粹是预算资金领取、使用和报销的财务活动。但随着科研单位的转制，其经营机制发生变化，科研单位筹资渠道多元化、投资方式多样化，科研单位经济活动日益复杂化、国际化，财务管理成为企业管理的一个重要组成部分。科研单位转制以来，在满足社会效益的同时也追求利润最大化，结合科研单位的战略要求，确定了财务管理工作的总体思路：以“收入、资产、资金”为核心，处理好三者的关系，优化资源的配置，确保技术创新平台的建设。在积极培育新的经济增长点、扩大产业规模、增加收入的同时，确保资产的可持续发展，保值增值，动态关注资金状况，保证资金链的良性循环。因此必须加强财务管理，提高财务管理水平，强化经费管理、实物管理、资金管理，加强财务分析和财务控制，探索成本管理、投资和筹资新策略，建立和健全各项财务管理基础工作和规章制度，形成集团化的管理。