【摘 要】
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CMK是MEP途径中的第四个关键酶,对于萜类合成代谢具有重要的影响.本研究基于实验室前期获得的山胡椒果实的转录组数据,经过注释筛选出CMK基因,首次从山胡椒中克隆得到萜类生
【机 构】
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北京林业大学生物科学与技术学院,北京,100083
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CMK是MEP途径中的第四个关键酶,对于萜类合成代谢具有重要的影响.本研究基于实验室前期获得的山胡椒果实的转录组数据,经过注释筛选出CMK基因,首次从山胡椒中克隆得到萜类生物合成关键基因LgCMK并对其生物信息学预测分析.结果 显示:LgCMK基因的开放阅读框为1 221 bp,编码406个氨基酸,分子量为44.78 kD,理论上等电点为6.26,属GHMP蛋白超家族.对LgCMK蛋白的氨基酸序列理化性质进行分析,发现蛋白亲水性指数为-0.332,不稳定性指数为41.77,属于亲水性不稳定蛋白;亚细胞定位预测结果显示该蛋白定位于叶绿体中.同源性和系统进化分析结果表明,与香樟、博落回和罂粟同源蛋白相似度较高分别为96.8％、75.96％和73.0％,不同物种的CMK具有较近的亲缘关系,与香樟同属一支,亲缘关系最近.通过本研究生物信息学分析将有助于对LgCMK深层次功能探究提供借鉴作用,同时为山胡椒的种质改良提供基因资源.
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