天府黑兔APOA4基因多态性及生物信息学分析

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为探究载脂蛋白A-Ⅳ (Apolipoprotein A-Ⅳ,APOA4)在天府黑兔群体中的遗传效应.本试验采用直接测序法检测天府黑兔APOA4基因第3外显子编码区内的单核苷酸多态性(SNPs)位点,并结合生物信息学软件分析其蛋白结构域和mRNA二级结构.结果 表明APOA4基因第3外显子编码区内检测发现3个遗传变异位点(c.1459 A→G、c.1648 G→A和c.1843 T→C)均为同义突变,位于APOA4的Pfam:Apolipoprotein蛋白结构域中,处于完全连锁状态,并选择c.1459 A→G位点进行遗传效应分析位,PIC=0.3447为中度多态(0.25<PIC<0.50).APOA4基因c.1459 A→G位点在肉品质选育中可能具有较高的潜力,以此为培育肉兔新品种提供分子依据.
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