基于网络药理学联合分子对接探究葛根芩连汤干预动脉粥样硬化的潜在分子机制

来源 :中国实验方剂学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:fist001
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基于网络药理学联合分子对接探究葛根芩连汤(以下简称GQL)干预动脉粥样硬化(AS)的潜在分子机制。从中药系统药理学数据库和分析平台(以下简称TCMSP)筛选GQL中各药材的活性成分及靶点,从7个数据库中查找AS相关基因,确定GQL治疗AS的靶基因。利用Cytoscape 3.8.0构建“成分-靶点”网络。利用STRING建立蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,并通过CytoNCA拓扑分析筛选核心靶点。运用R clusterProfiler对目标基因进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析,预测其富集的信号通路并以多种图可视化展示。最后将活性强度前十位的成分作为配体,与筛选得到AS核心靶点进行分子对接分析,并与阿托伐他汀的结合度进行对比。最终得到GQL活性成分150个,AS疾病靶点20289个,交集靶点213个。经过筛选,获取核心交集靶点48个,GO和KEGG富集分析发现其功能主要与细胞核受体活动、配体的激活、转录因子活动等有关,富集在流体剪切力与AS、晚期糖基化终产物及其受体(AGE-RAGE)、白细胞介素-17(IL-17)、肿瘤坏死因子(TNF)、Toll样受体通路等与AS关系密切的信号通路。分子对接结果显示GQL效应成分与AS核心靶点结合较好,甚至优于阿托伐他汀,结合度最好的5组关系分别是puerarin-TNF,baicalein-诱导型一氧化氮合酶(NOS2),puerarin-NOS2,formononetin-NOS2,wogonin-NOS2,以上研究为该经典名方日后进一步探索提供了新思路。
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