马尾松PmCOMT基因的克隆及实时定量表达分析

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在木质素生物合成里,咖啡酸-O-甲基转移酶(caffeic acid-O-methyltransferase,COMT)起重要作用.本论文以马尾松幼苗作为材料,并通过PCR技术以及RACE技术从马尾松材料中克隆出PmCOMT基因的cDNA全长.该cDNA全长为1 660 bp,其中预测完整ORF全长为1 125bp,可编码374个氨基酸的蛋白.蛋白相对分子质量为41.81 kD;等电点(pI)为5.03,总平均亲水性为-0.311.通过生物信息学的方法对其进行分析表明,PmCOMT基因具有典型的甲基转移酶的保守结构域.通过实时荧光定量表达分析表明,COMT基因在马尾松的不同组织均有表达,其中在新梢中的表达量最高,树皮中表达量最低.
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