【摘 要】
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目的:从生物信息学角度探索与子宫颈癌(CC)相关的生物标记物,为早期诊断提供依据;同时为中医药治疗提供生物信息学证据并为中药治疗的靶点探索提供方向.方法:从基因表达综合
【机 构】
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黑龙江中医药大学,哈尔滨150040;黑龙江中医药大学附属第一医院,哈尔滨150040
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目的:从生物信息学角度探索与子宫颈癌(CC)相关的生物标记物,为早期诊断提供依据;同时为中医药治疗提供生物信息学证据并为中药治疗的靶点探索提供方向.方法:从基因表达综合数据库(GEO)中检索和下载CC微阵列数据集,鉴定差异表达基因(DEGs).采用STRING数据库构建宫颈癌DEGs蛋白-蛋白相互作用网络图(PPI网络).利用Cytoscape中的MCODE识别PPI网络中最显著模块获得hub基因,并使用DAVID数据库对其进行GO分析和KEGG分析.此外,复习当今中医药治疗CC的机制研究,与生物信息学预测的生物标记物进行对比分析,从生物信息学角度验证其有效性.结果:共得到3个微阵列数据集(GSE63514、GSE7410、GSE7803),与非癌组织比较,CC组织中有65个DEGs,其中hub基因15个(degree＞ 10).GO分析和KEGG分析显示,这些基因的生物学功能主要富集于细胞分裂、细胞周期和DNA复制等.复习当今文献发现许多中药能作用于上述标记物,可从细胞周期阻滞、干扰DNA复制等途径干预肿瘤的发展,与生信分析结果相一致.此外还有一些生物标记物缺少动物、细胞或人体实验的验证,是未来中药抗肿瘤药物的研究方向.结论:微阵列分析可预测早期诊断CC的标记物,为中药的抗肿瘤功效提供生信依据,并为未来中药抗肿瘤的研发提供方向.
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