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在考虑高校教学、科研、社会服务三项产出和人员、财力、物资三项投入的指标体系基础上,使用随机前沿法,以2005~2010年教育部68所直属高校为样本,评价高校的成本效率并分析其影响因素。结果发现,中国高校成本效率处于下降趋势;东部地区高校的成本效率值最高,西部次之,中部最差;高校的地理位置、重点与否、教师的职称结构、生师比、学生的学历结构以及高校规模都显著影响高校的成本效率;"985工程"高校比非"985工程"高校的成本效率更高。