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以新冠肺炎疫情为例,分析了重大突发公共卫生事件中医疗数据共享中存在的伦理冲突,包括公共利益与个体隐私的冲突、数据挖掘与知情同意的冲突、多重利益主体与数据权益模糊的冲突。探讨了从做好共享数据隐私保护的技术研究、提高共享数据使用价值透明度、明确数据共享各方的权利义务边界、完善数据共享伦理监测机制四个方面做好重大突发公共卫生事件中医疗数据共享的伦理学应对。