【摘 要】
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目的:运用网络药理学方法构建药物活性成分-疾病-靶点关系网络,通过核心靶点与主要活性成分分子对接,探究小青龙汤治疗慢性阻塞性肺疾病(Chronic Obstructive Pulmonary Disease,COPD)的作用机制.方法:从中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacolgy Database and Analysis Platform,TCMSP)检索筛选小青龙汤活性成分及其对应靶点,通过Unipot数据库检索人类
【机 构】
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甘肃中医药大学,甘肃 兰州,730000;甘肃中医药大学附属医院,甘肃 兰州,730000
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目的:运用网络药理学方法构建药物活性成分-疾病-靶点关系网络,通过核心靶点与主要活性成分分子对接,探究小青龙汤治疗慢性阻塞性肺疾病(Chronic Obstructive Pulmonary Disease,COPD)的作用机制.方法:从中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacolgy Database and Analysis Platform,TCMSP)检索筛选小青龙汤活性成分及其对应靶点,通过Unipot数据库检索人类基因对其靶点简化注释,然后与GeneCards、OMIM、PharmGkb、TTD、DrugBank数据库获取的疾病靶点相映射取交集;将药物活性成分及交集靶点导入Cytoscape 3.8.0软件,构建药物活性成分-疾病-靶点关系网络;运用String平台进行蛋白互作网络分析,再使用Cytoscape 3.8.0软件筛选出14个关键基因,运用R 4.0.4软件对关键靶点进行基因本体论(Gene Ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析并作关键靶点-成分网络示图,根据关键靶点-成分中Degree值分别筛选出前5个核心靶点和活性成分,最后运用AutoDock软件进行分子对接.结果:小青龙汤中筛选出有效成分169个,关键有效成分5个,分别是槲皮素、木犀草素、甘草酮、山奈酚、柚皮素;交集靶点221个,关键靶点14个(分别是STAT3、JUN、TP53、TNF、AKT1、RELA、MAPK1、MAPK3、MYC、CDKN1A、CCND1、MAPK14、RB1、CXCL8);GO分析得出1444条生物学过程(Biological Process,BP),43个分子功能(Molecular Function,MF),44个细胞组分(Cellular Component,CC);KEGG分析得出与COPD关系密切的Toll样受体信号通路、白细胞介素-17(Interleukin-17,IL-17)信号通路、T细胞受体等富集信号通路146条;分子对接结果显示所有核心靶点与成分都具有一定的结合活性,且大部分具有较好的结合活性.结论:小青龙汤在干预COPD中体现了多成分、多靶点、多通路特征,该结果可为进一步深化小青龙汤治疗COPD的机制的研究提供思路.
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