RNA-Seq探索基底型乳腺癌干细胞差异表达基因

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基底型乳腺癌许多特性与肿瘤干细胞十分相似,为筛选出基底型乳腺癌的关键靶点,从乳腺癌干细胞入手,采用乳腺癌干细胞标志物CD44~+ CD24~(-/low)流式分选HCC1937和SUM149PT乳腺癌细胞系的干细胞及非干细胞,利用高通量转录组测序筛选干细胞和非干细胞差异表达的基因,并对其进行相关生物信息学分析,最后随机选取部分差异表达基因进行qRT-PCR验证。结果表明筛选出的关键差异表达基因共134个,其中39个基因在干细胞中上调,95个基因下调。从生物过程、细胞组分、分子功能3方面GO功能分类表明,差
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