牦牛TLR-4基因3'-UTR区扩增克隆及相关miRNAs生物信息学分析

来源 :中国兽医杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:juyuyong
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本试验采用构建DNA混池和测序的方法,对西藏、青海341头牦牛TLR-4基因3\'-UTR区单核苷酸多态性(SNP)位点进行筛选,然后用DNAMAN 8.0软件进行序列对比分析,并通过TargetScan 7数据库预测牦牛TLR-4基因3\'-UTR区的微小RNAs (miRNAs)的可能靶定.结果 显示,牦牛TLR-4基因3\'-UTR区可能存在2个SNP位点,分别为A38UG和A382G,通过TargetScan7数据库在线预测到牦牛TLR-4基因3\'-UTR区共18个miRNAs可能靶定.本试验为牦牛TLR-4基因3\'-UTR区可能存在的A380G和A382G突变位点与所预测的miRNAs之间靶向验证提供了初步理论根据,提示可通过分子水平进行抗病育种提高牦牛群体免疫力.
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为明确奶牛产后卵巢静止与肝脏功能的内在联系,以肝功指数(liver function index,LFI)为自变量,分为低LFI组(n=30头)和高LFI组(n=30头),采用B超、队列研究的M-H x2检验分析、双变量相关分析、二元Logistic回归模型和ROC分析的方法,分析60头奶牛产后21 d血浆中氧化应激、能量代谢、矿物质、激素等指标和50~55 d卵泡发育状况,并确定LFI对奶牛卵巢静止的风险预测值.结果 显示,低LFI的奶牛在产后21d的SOD、GSH、GH、Glu极显著降低(P<0.01
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