【摘 要】
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试验旨在揭示瑶鸡2个群体YA(贵州瑶山鸡)和YB(南丹瑶鸡)之间的遗传距离和亲缘关系,为培育市场需求的瑶鸡配套系提供参考和帮助.从YA和YB群体中分别随机抽取25只鸡,利用“京芯一号”鸡55K芯片对瑶鸡2个群体的亲缘关系进行遗传分析.通过主成分分析,瑶鸡2个群体个体随机聚在一起,没有出现明显的分别聚类现象,遗传背景相似.G矩阵和IBS矩阵表明瑶鸡2个群体大多数个体间亲缘关系较远.使用邻接(Neighbor-Joining,NJ),基于IBS遗传距离分析结果对2个群体样本进行聚类,结果表明YA和YB分别聚为
【机 构】
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江苏省家禽科学研究所,江苏省家禽遗传育种重点实验室,江苏扬州 225125;广西富凤农牧集团有限公司,广西南宁 530024
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试验旨在揭示瑶鸡2个群体YA(贵州瑶山鸡)和YB(南丹瑶鸡)之间的遗传距离和亲缘关系,为培育市场需求的瑶鸡配套系提供参考和帮助.从YA和YB群体中分别随机抽取25只鸡,利用“京芯一号”鸡55K芯片对瑶鸡2个群体的亲缘关系进行遗传分析.通过主成分分析,瑶鸡2个群体个体随机聚在一起,没有出现明显的分别聚类现象,遗传背景相似.G矩阵和IBS矩阵表明瑶鸡2个群体大多数个体间亲缘关系较远.使用邻接(Neighbor-Joining,NJ),基于IBS遗传距离分析结果对2个群体样本进行聚类,结果表明YA和YB分别聚为一大类,说明两个群体遗传距离较远,群体间亲缘关系相对较远.瑶鸡2个群体基于长纯合片段(Runs of homozygosity,ROH)的平均近交系数(FROH)为0.031 21,YA和YB群体近交系数分别为0.032 75和0.029 66,近交系数都很低.瑶鸡YA、YB群体的期望杂合度(He)分别为0.388 9、0.388 3,YA和YB群体观察杂合度(Ho)分别为0.400 1、0.400 3,说明瑶鸡两个群体的遗传多样性较低,群体的选育程度较高,整齐度较好.综合分析表明,瑶鸡两个群体近交系数很低,亲缘关系较远,遗传多样性较低.
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