ClassI新城疫病毒NP基因分子特征的研究

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为分析2002-2007年ClassⅠ新城疫病毒分离株NP基因的分子特征,以及其在新城疫病毒演化过程中所起的作用,采用RT—PCR方法扩增分离株的核衣壳蛋白(NP)基因,并进行了测序,应用生物信息学软件分析NDV NP基因的分子特征。根据NP基因序列的遗传发生分析表明,ClassⅠNDV 2型毒株与DE/R49—99和美国株亲缘关系较近,而3型毒株与其他ClassⅠ毒株遗传关系较远,具有地区特色,形成一个独立的分支。生物信息学软件分析表明,NP蛋白N端1-400氨基酸比较保守,而C端序列(特别是氨基酸残基
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