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基因沉默（Gene silence）：转基因动植物中往往会遇到这样的情况，外源基因存在于生物体内，并未丢失或损伤，但该基因不表达或表达量极低，这种现象称为基因沉默（gene silence）。一般认为基因沉默有三种情况：位置效应的基因沉默、转录水平的基因沉默和转录后水平的基因沉默。开始科学家一直在努力解决如何避免基因沉默的问题。目前主要的对策是在构建表达载体时，尽可能避免外源基因与内源序列同源性过高，或者选择甲基化酶活性低的受体细胞，或选择外源基因在生物体内为单拷贝的转基因生物。近来发现基因沉默可用于治疗